| 1925 | E. Aubert de la Rüe. Note sur un gisement de molibdénite dans la vallée l'Oued Aker, dans le Haut Atlas marocain | — | — |
| 1927 | Contribution à l'étude minéralogique de la Côte d'Ivoire | Sans nom d'éditeur (s. n.) | 194 |
| 1927 | E. Aubert de la Rüe. Contribution à l'étude minéralogique de la Côte d'Ivoire... | — | — |
| 1927 | Sur quelques minéraux de la Côte-d'Ivoire | (s. d.) | 3 |
| 1927 | Sur quelques minéraux de la Côte-d'Ivoire. Note de M. Edgar Aubert de la Rüe | — | — |
| 1928 | Carte des gisements minéraux de la Côte d'Ivoire | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1928 | E. Aubert de la Rüe. Contribution à l'étude géologique de la Côte d'Ivoire | — | — |
| 1928 | E. Aubert de la Rüe. Observations sur quelques pierres précieuses marocaines | — | — |
| 1928 | Pierres précieuses et pierres d'ornementation | Librairie Paul Lechevalier | 301 |
| 1928 | Sur un mollusque fossile de la Côte d'Ivoire | — | — |
| 1929 | E. Aubert de la Rüe. Observations sur les gisements de manganèse de la Côte d'Ivoire... | — | — |
| 1929 | E. Aubert de la Rüe. Reconnaissances géologiques dans la Bas-Cavally (Côte d'Ivoire)... | — | — |
| 1929 | Sur l'existence de l'agate et du spath d'Islande dans l'archipel de Kerguelen. Note de M. Edgar Aubert de la Rüe | — | — |
| 1929 | Sur la constitution géologique de l'île Heard. Note du M. Edgar Aubert de la Rüe | — | — |
| 1929 | Sur quelques minéraux des îles Kerguélen (note préliminaire) | — | — |
| 1930 | E. Aubert de la Rüe. Voyage d'exploration à l'île Heard... | — | — |
| 1930 | Le Climat des îles Kerguelen | — | — |
| 1930 | Note préliminaire sur la géologie et la pétrographie des îles Kerguelen | — | 4 |
| 1930 | Quelques mots sur la climatologie des îles Kerguelen | — | — |
| 1930 | Terres françaises inconnues | Société parisienne d'édition | 192 |
| 1930 | Un voyage d'exploration dans les mers australes | les Presses Universitaires de France | 50 |
| 1931 | L'Ile de la Nouvelle Amsterdam | — | — |
| 1931 | La pêche aux îles Saint-Paul et Amsterdam | — | — |
| 1931 | Nouvelles observations sur la météorologie des îles Kerguelen | — | — |
| 1931 | Observations sur la géologie de l'île Saint-Paul (Océan Indien) | — | — |
| 1931 | Sur l'existence d'une roche sédimentaire dans l'île de la Réunion | — | — |
| 1931 | Sur l'extension des roches éruptives grenues dans l'archipel de Kerguelen | — | 4 |
| 1931 | Sur la présence d'une flore fossile tertiaire dans l'archipel de Kerguelen | — | 4 |
| 1931 | Une excursion géologique à La Réunion et à l'île Maurice | — | — |
| 1931 | Voyage aux îles Amsterdam, Saint-Paul et Kerguelen | — | — |
| 1932 | Edgar Aubert de la Rue,... Étude géologique et géographique de l'archipel de Kerguelen | — | — |
| 1932 | Esquisse géologique de l'archipel de Kerguelen | imp. de l'Institut cartographique de Paris | — |
| 1932 | Les gisements miniers et minéraux des Etats du Levant sous mandat français | Larose | 24 |
| 1932 | Premiers résultats d'une mission géologique aux îles Saint-Pierre et Miquelon | — | — |
| 1932 | Étude géologique et géographique de l'archipel de Kerguelen... | Revue de géographie physique et de géologie dynamique | 231 |
| 1934 | E. Aubert de la Rüe. Une expédition au Yurumangui et au Naya, fleuves de la Cordillère occidentale des Andes de Colombie | — | — |
| 1935 | E. Aubert de la Rüe. L'Homme et les îles... | — | — |
| 1935 | L'Homme et les îles. Photographies de l'auteur | Gallimard | 194 |
| 1936 | Premiers résultats d'une mission géologique aux nouvelles Hébrides | — | — |
| 1937 | Erromango et ses habitants | — | 6 |
| 1937 | L'archipel des Nouvelles Hébrides, en Mélanésie | — | — |
| 1937 | L'intérêt touristique des îles Saint-Pierre et Miquelon | — | — |
| 1937 | La culture et l'alimentation chez les indigènes des Nouvelles-Hébrides | — | — |
| 1937 | La culture et l'élevage aux îles Saint-Pierre et Miquelon | — | — |
| 1937 | Le territoire de St Pierre et Miquelon, étude de géographie physique et humaine | — | — |
| 1937 | Le volcanisme aux Nouvelles Hébrides | Impr. Giannini y Figli | 63 |
| 1937 | Les divers aspects de la végétation aux Nouvelles Hébrides | — | — |
| 1937 | Les gisements d'or de la Mélanésie | — | — |
| 1937 | Les îles Futuna et Alofi | — | — |
| 1937 | Les îles Wallis et Futuna | — | — |
| 1937 | lles Wallis | — | — |
| 1939 | Aspect général de la flore en Somalie française | — | — |
| 1939 | La Somalie française | Gallimard | 162 |
| 1939 | La Somalie française. Photographies de l'auteur | Gallimard | 164 |
| 1939 | La Somalie française. Photographies de l'auteur. 4e édition | — | — |
| 1939 | Le volcanisme en côte française des Somalis | Typ. F. Giannini | — |
| 1939 | Les caractères physiques de la Côte française des Somalis | — | — |
| 1940 | L'homme et le vent | Gallimard | 219 |
| 1944 | E. Aubert de la Rüe. Saint-Pierre et Miquelon | Éditions de l'Arbre | 263 |
| 1945 | Les Nouvelles Hébrides, îles de cendre et de corail. Photographies et dessins de l'auteur | — | — |
| 1950 | Carte géologique des îles Saint-Pierre et Miquelon | Ministère de la France d'Outre-Mer, Office de la Recherche Scientifique Outre-Mer | — |
| 1950 | Carte géologique des îles Saint-Pierre-et-Miquelon par E. Aubert de la Rüe. 1 | Office de la Recherche scientifique Outre-mer (Impr. nationale) | — |
| 1950 | Quelques observations sur les Oyampi de l'Oyapock (Guyane française) | — | — |
| 1950 | Terres françaises | — | — |
| 1951 | Les Iles de Saint-Pierre et Miquelon | La documentation française | — |
| 1951 | Recherches géologiques et minières aux îles Saint-Pierre et Miquelon | — | — |
| 1952 | Explorations outre-mer | La documentation française | 221 |
| 1953 | Les terres australes | Presses universitaires de France | 128 |
| 1953 | Reconnaissance géologique de la Guyane française méridionale | Office de la Recherche scientifique Outre-mer (Impr. nationale) | 127 |
| 1953 | Reconnaissance géologique de la Guyane française méridionale, 1948-1949-1950 | Office de la Recherche scientifique Outre-mer (Impr. nationale) | 127 |
| 1954 | Deux ans aux îles de la Désolation(archipel de Kerguelen). Photographies de l'auteur | — | — |
| 1954 | Edgar Aubert de La Rüe,... François Bourlière,... Jean-Paul Harroy,... Tropiques | — | — |
| 1956 | L'homme et les îles | Gallimard | 215 |
| 1957 | Brésil aride (la vie dans la caatinga) | Gallimard | 247 |
| 1957 | L'Amérique du sud 1 | impr. de Odé | 416 |
| 1958 | L'homme et les volcans | Gallimard | 398 |
| 1958 | Tahiti et ses archipels, Polynésie française... [Photographies de l'auteur.] | — | — |
| 1959 | Recherche géologique et minérale en Polynésie Française | Inspection générale des mines et de la géologie | 60 |
| 1966 | Les sciences naturelles dans les îles australes françaises, de leur découverte à 1945 | Impr. de l'Institut géographique national | 62 |