| 1863 | De la greffe animale | Martinet | 110 |
| 1863 | Sur un monstre double autositaire de la famille des monosomiens (Isidore Geoffroy-Saint-Hilaire)... | impr. de E. Thunot | 16 |
| 1864 | Absorption. (Par Paul Bert.) | impr. de S. Raçon | — |
| 1864 | Catalogue méthodique des animaux vertébrés qui vivent à l'état sauvage dans le département de l'Yonne | V. Masson et fils | 129 |
| 1865 | Le professeur Pierre Gratiolet | Impr. de Parent | 8 |
| 1865 | Revue des travaux d'anatomie et de physiologie publiés en France pendant l'année 1864, par M. le Dr Paul Bert,... présentée au Congrès des sociétés savantes | F. Le Blanc-Hardel | 61 |
| 1866 | Recherches expérimentales pour servir à l'histoire de la vitalité propre des tissus animaux | impr. de E. Martinet | 95 |
| 1866 | Recherches expérimentales pour servir à l'histoire de la vitalité propre des tissus animaux par Paul Bert,... Thèse présentée à la Faculté des sciences de Paris... | impr. de E. Martinet | 96 |
| 1866 | Éloge de Pierre Gratiolet, par le Dr Paul Bert,... prononcé le 4 mai 1866 à la séance publique annuelle de la Société de secours des amis des sciences | Impr. de C. Lahure | 31 |
| 1867 | La machine humaine | Hachette | 53 |
| 1867 | Notes d'anatomie et de physiologie comparées, par le Dr Paul Bert,... 1re série | J.-B. Baillière | 47 |
| 1867 | Recherches sur les mouvements de la sensitive ("Mimosa pudica", Linn.) | J.-B. Baillière | 38 |
| 1868 | Notice sur les titres et travaux scientifiques du Dr Paul Bert,... | impr. de E. Martinet | 48 |
| 1870 | Leçons sur la physiologie comparée de la respiration professées au Muséum d'histoire naturelle | J.-B. Baillière | 48 |
| 1873 | Recherches expérimentales sur l'influence que les modifications dans la pression barométrique exercent sur les phénomènes de la vie | G. Masson | 167 |
| 1874 | Rapport fait au nom de la Commission chargée d'examiner le projet de loi relatif à la concession d'une pension à M. Pasteur, membre de l'Académie des sciences de l'Institut de France, et professeur à la Faculté des sciences de Paris | Impr. de Cerf et fils | 94 |
| 1874 | Rapport sur le projet de loi tendant à accorder à M. Pasteur une récompense nationale, présenté à l'Assemblée Nationale, le 12 juillet 1874, par M. Paul Bert,... | — | — |
| 1875 | Conclusion du Rapport de la commission de l'Assemblée nationale qui fut chargée d'examiner le projet de loi accordant à M. Pasteur une pension à titre de récompense nationale | Gauthier-Villars | — |
| 1876 | Conclusions du Rapport de la Commission de l'Assemblée nationale qui fut chargée d'examiner le projet de loi accordant à M. Pasteur une pension à titre de récompense nationale | Gauthier-Villars | 3 |
| 1876 | Conférence sur l'influence des changements considérables de la pression de l'air sur les êtres vivants, par M. Paul Bert... | Impr. Lahure | 27 |
| 1876 | Proposition de loi tendant à instituer une commission pour l'étude des moyens propres à prévenir les explosions de grisou, présentée par MM. Paul Bert, Bertholon, Brossard, Chavassieu, Cherpin, Crozet-Fourneyron... députés | Impr. de Cerf et fils | 1 |
| 1878 | La Pression barométrique, recherches de physiologie expérimentale, par Paul Bert,... | G. Masson | 1168 |
| 1878 | Notice sur les travaux scientifiques | impr. d' Émile Martinet | 77 |
| 1878 | Notice sur les travaux scientifiques de M. Paul Bert, professeur de physiologie... | impr. d' Émile Martinet | 70 |
| 1879 | Discours de M. Paul Bert, président perpétuel de la Société de biologie | impr. de Cusset | 7 |
| 1879 | Discours prononcé par M. Paul Bert... le 5 août 1879, à la distribution des prix du lycée Fontanes | impr. de C. Murat | 13 |
| 1879 | [Recueil. Dossiers biographiques Boutillier du Retail. Documentation sur Paul Bert] | La Nouvelle revue | — |
| 1880 | La morale des Jésuites | Charpentier | 666 |
| 1880 | Rapport présenté à la Chambre des Députés sur la loi de l'enseignement primaire (proposition Barodet), par M. Paul Bert,... | G. Masson | 364 |
| 1880 | Rapport présenté à la Chambre des députés sur la loi de l'enseignement primaire (proposition de M... Baradet) | G. Masson | — |
| 1880 | Rapport sur l'instruction primaire, par M. Paul Bert,... (6 décembre 1879.) | impr. de A. Quantin | 347 |
| 1881 | 9 juin 1881. École alsacienne. Section classique... section élémentaire. Inauguration des nouveaux bâtiments. Discours | impr. de Cerf | 27 |
| 1881 | Banquet offert à M. Paul Bert par les instituteurs de France. 18 septembre 1881. Discours de M. Paul Bert | impr. de C. Murat | 35 |
| 1881 | Bibliothèque pédagogique du journal "L'Ecole". L'Enseignement laïque, par Paul Bert,... Discours prononcé à la Chambre des députés, dans la séance du 5 décembre 1881 | Picard-Bernheim | — |
| 1881 | Discours parlementaires. Assemblée nationale, Chambre des députés, (1872-1881) | G. Charpentier | — |
| 1881 | L'Instruction religieuse dans l'école, conférence faite au Cirque-d'Hiver... le 28 août 1881... par Paul Bert | aux bureaux du journal "l'École" | 71 |
| 1881 | L'instruction religieuse dans l'école. Conférence faite au Cirque-d'Hiver... le 28 août 1881... | aux bureaux du journal "l'École" | — |
| 1881 | L'oeuvre de Claude Bernard | J.-B. Baillière | 384 |
| 1881 | Leçons de zoologie | — | — |
| 1881 | Leçons de zoologie professées à la Sorbonne, enseignement secondaire des jeunes filles | G. Masson | — |
| 1881 | Leçons de zoologie, professées à la Sorbonne, enseignement secondaire des jeunes filles, par M. Paul Bert,... Anatomie, physiologie... | G. Masson | 561 |
| 1881 | Leçons, discours et conférences, par Paul Bert,... | G. Charpentier | 464 |
| 1881 | Premières Notions de zoologie, par Paul Bert,... | G. Masson | 229 |
| 1881 | Premières Notions de zoologie, par Paul Bert,... | G. Masson | 229 |
| 1882 | Bibliothèque pédagogique. Chambre des députés. Rapport fait au nom de la commission chargée d'examiner la proposition de loi de M. Paul Bert sur l'organisation de l'enseignement primaire et le projet de loi relatif à la nomination et au traitement des instituteurs et institutrices primaires | Picard-Bernheim | — |
| 1882 | Discours prononcé par M. Paul Bert à l'occasion du banquet qui lui a été offert par les instituteurs et les institutrices de France, le 18 septembre 1881, suivi de la liste des souscripteurs au banquet et de celle des souscripteurs à la médaille et au buste | Picard-Bernheim et Cie | 68 |
| 1882 | L'Instruction religieuse dans l'école, conférence faite au Cirque-d'Hiver... le 28 août 1881... par Paul Bert | Picard-Bernheim et Cie | 71 |
| 1882 | L'instruction civique à l'école | Picard-Bernheim | 178 |
| 1882 | L'instruction religieuse dans l'école. Conférence faite au Cirque-d'Hiver... le 28 août 1881... | Picard-Bernheim | — |
| 1882 | La Première Année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 336 |
| 1882 | Lectures sur l'histoire naturelle des animaux, suivies d'un vocabulaire des mots techniques employés dans l'ouvrage, par Paul Bert,... | Hachette | 394 |
| 1882 | Rapport fait au nom de la Commission chargée d'examiner | Picard-Bernheim et Cie | 81 |
| 1883 | De l'Éducation civique, conférence faite au palais du Trocadéro, le 6 août 1882... par M. Paul Bert,... | Picard-Bernheim | 36 |
| 1883 | Histoire naturelle. Anatomie et physiologie animales, par Paul Bert,... | G. Masson | 378 |
| 1883 | La Première Année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 336 |
| 1883 | Premières Notions de zoologie, par Paul Bert,... | G. Masson | 229 |
| 1884 | Discours sur la nomination des instituteurs, prononcé à la Chambre des Députés, dans la séance du 4 mars 1884, par M. Paul Bert,... | C. Delagrave | 24 |
| 1884 | Discours sur la nomination des instituteurs, prononcé à la Chambre des députés, dans la séance du 4 mars 1884 | G. Delagrave | — |
| 1884 | La Première Année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 336 |
| 1884 | La première année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 336 |
| 1884 | Le choléra, lettres au "Tagblatt" de Vienne | P. Ollendorff | 71 |
| 1885 | A l'ordre du jour | P. Ollendorff | 348 |
| 1885 | La Première Année (nouvelle) d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 167 |
| 1885 | Lettres de Kabylie | A. Lemerre | 82 |
| 1885 | Premières notions de zoologie | G. Masson | 299 |
| 1885 | Éléments de zoologie | G. Masson | 692 |
| 1886 | Discours prononcés à l'inauguration de la statue de Claude Bernard à Paris, le 7 février 1886 | Firmin-Didot et Cie | 22 |
| 1886 | Leçons d'anatomie et de physiologie animales | G. Masson | 260 |
| 1886 | Premiers éléments de géométrie expérimentale appliquée à la mesure des longueurs, des surfaces et des volumes | C. Delagrave | 92 |
| 1887 | La première année d'enseignement scientifique | A. Colin | 167 |
| 1887 | Lectures et leçons de choses... | A. Picard-Bernheim | 210 |
| 1887 | Plan d'alignements dressé | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1887 | Premiers Éléments de géométrie expérimentale appliquée à la mesure des longueurs, des surfaces et des volumes, par Paul Bert,... | C. Delagrave | 92 |
| 1888 | La Deuxième année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques... par Paul Bert. 17e édition | — | — |
| 1888 | La deuxième année d'enseignement scientifique (sciences naturelles et physiques) | A. Colin | 336 |
| 1889 | Les colonies françaises | C. Bayle | 235 |
| 1891 | L'Année préparatoire d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 128 |
| 1895 | La Deuxième Année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques... par Paul Bert. 30e édition | A. Colin | 336 |
| 1900 | La Première Année (nouvelle) d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques | A. Colin | 167 |
| 1900 | Le Cléricalisme, questions d'éducation nationale, avec une préface de A. Aulard,... | A. Colin | 326 |
| 1900 | Le Cléricalisme, questions d'éducation nationale, avec une préface de A. Aulard,... (Octobre 1899.) | A. Colin | — |
| 1901 | La Deuxième Année d'enseignement scientifique, sciences naturelles et physiques... par Paul Bert. 30e édition | A. Colin | 368 |
| 1902 | Lectures et leçons de choses, avec 150 gravures expliquées | A. Picard et Kaan | 210 |
| 1908 | Histoire de la révocation de l'Edit de Nantes à Bordeaux et dans le Bordelais (diocèse de Bordeaux) (1653-1715) | M. Mounastre-Picamilh | 106 |
| 1908 | Histoire de la révocation de l'Edit de Nantes à Bordeaux et dans le Bordelais (diocèse de Bordeaux) (1653-1715), par Paul Bert, avec préface de M. Camille Jullian,... | — | — |
| 1910 | L'année préparatoire d'enseignement scientifique (sciences naturelles et physiques) | A. Colin | 138 |
| 1923 | La Première année d'enseignement scientifique | A. Colin | 168 |
| 1923 | La Première année d'enseignement scientifique | — | — |
| 1924 | Lamartine 'Homme social'. Son action départementale | Impr.-éditeurs Jouve et Cie, 15, rue Racine | 259 |
| 1924 | Lamartine «homme social» | impr. de Jouve | 258 |
| 1947 | Lamartine, "homme social" | impr. de Jouve | 252 |
| 1947 | Lamartine, homme social, son action dans la région natale | impr. de Jouve | 253 |
| 1978 | Histoire de la révocation de l'édit de Nantes à Bordeaux et dans le Bordelais | Mégariotis | 106 |
| 1978 | Histoire de la révocation de l'édit de Nantes à Bordeaux et dans le Bordelais | Mégariotis | 106 |
| 1979 | La Pression barométrique | Editions du C.N.R.S. (Impr. nationale) | 1183 |
| 1986 | Le Catalogue des Vertébrés de l'Yonne | Centre régional de documentation pédagogique, 1, rue du Périgord (Impr. universitaire) | 150 |