| 1877 | Malebranche, d'après des manuscrits inédits de la Bibliothèque nationale | G. Baillière | — |
| 1877 | Sur quelques doutes élevés à propos d'épigrammes de Racine et de Boileau | — | — |
| 1878 | Sur l'origine de la convention dite de Descartes | Didier | 11 |
| 1879 | Huygens et Roberval, documents nouveaux | E. J. Brill | 43 |
| 1879 | Huygens et Roberval. Documents nouveaux | — | — |
| 1879 | Les Manuscrits de Sophie Germain et leur récent éditeur, documents nouveaux | G. Baillière | — |
| 1879 | Sur l'origine de quelques notations mathématiques... | — | — |
| 1879 | Sur une valeur approchée de @ 2 et sur deux approximations de @ 3 | — | — |
| 1879 | Un érudit homme du monde, homme d'église, homme de cour (1630-1721) | Hachette | 126 |
| 1880 | Galilée, Torricelli, Cavalieri, Castelli, documents nouveaux tirés des bibliothèques de Paris par Charles Henry | coi tipi del Salviucci | 20 |
| 1880 | Galilée, Torricelli, Cavalieri, Castelli. Documents nouveaux tirés des bibliothèques de Paris par M. Charles Henry | — | — |
| 1880 | Généralisation d'un théorème d'arithmétique | — | — |
| 1880 | Liste des travaux de M. Charles Henry, secrétaire de la Section de mathématiques... au congrès de l'association française pour l'avancement des sciences | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 6 |
| 1880 | Liste des travaux de M. Charles Henry,... | — | — |
| 1880 | Notes sur divers points d'histoire des mathématiques grecques | — | — |
| 1880 | Recherches sur les manuscrits de Pierre de Fermat, suivies de fragments inédits de Bachet et de Malebranche | Impr. des sciences mathématiques et physiques | — |
| 1880 | Remarque sur un article des Nouvelles Annales | — | — |
| 1880 | Sur divers points de la théorie des nombres, remarques historiques... | — | 7 |
| 1880 | [Lettre adressée au directeur de la Gazette anecdotique au sujet du jeun Le Taquin | — | — |
| 1880 | [Lettre à Monsieur le Rédacteur du Bulletin des sciences mathématiques, signée | — | — |
| 1881 | Deux pages inédites de la vie de Frédéric le Grand... | — | — |
| 1881 | Sur le calcul des dérangements | — | — |
| 1881 | Sur un procédé particulier de division rapide, par M. C. Henry. [- Décomposition des nombres f⁽1⁽2-9g⁽1⁽2 et du double de ces nombres en deux cubes rationnels | — | — |
| 1881 | Étude sur le triangle harmonique | Gauthier-Villars | 18 |
| 1882 | Les Deux plus anciens traités français d'algorisme et de géométrie, publiés par M. Charles Henry,... | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 24 |
| 1882 | Les ressorts-battants de la chirobaliste d'Héron d'Alexandrie..., par Victor Prou | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1882 | Notice sur un manuscrit inédit de Claude Mydorge | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 82 |
| 1882 | Rapporteur esthétique de M. Charles Henry permettant l'étude et la rectification esthétique de toute forme | G. Seguin | 22 |
| 1882 | Supplément à la bibliographie de Gergonne | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 10 |
| 1882 | Sur quelques propositions inédites de Fermat. Note de C. Henry. (Séance du 3 décembre 1882.) | — | — |
| 1883 | Die Maase der Erdthule nash Plinius Gluckstadt... [par] Detlefsen | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1883 | Les Connaissances mathématiques de Jacques Casanova de Seingalt | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 33 |
| 1884 | L'encaustique et les autres procédés de peinture chez les anciens | J. Rouam | 130 |
| 1884 | L'introduction harmonique de Cléonide, la division du canon d'Euclide... | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1884 | Pierre de Carcavy, intermédiaire de Fermat, de Pascal et de Huygens, bibliothécaire de Colbert et du roi, directeur de l'Académie des sciences | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 77 |
| 1884 | Principales publications de M. Charles Henry | J. Rouam | 2 |
| 1885 | Introduction à une esthétique scientifique | Revue contemporaine | 31 |
| 1885 | L'oeuvre scientifique de Léonard de Vinci | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1885 | Les microbes de l'atmosphère | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1886 | Le Troisième volume de M. Henri Doniol | Impr. de C. Hérissey | 10 |
| 1886 | Stendhal inédit | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1886 | Vision | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1887 | La théorie de Rameau sur la musique | Publications de La Vogue, A. Hermann | 15 |
| 1887 | Voltaire et le Cardinal Quirini, d'après des documents nouveaux... | E. Dentu | 96 |
| 1887 | Wronski et l'esthétique musicale | — | — |
| 1887 | Wronski et l'esthétique musicale | A. Hermann | 41 |
| 1888 | Cercle chromatique | C. Verdin | 168 |
| 1888 | Lettre à Monsieur le prince D. B. Boncompagni sur divers points d'histoire des mathématiques | Impr. des sciences mathématiques et physiques | 17 |
| 1888 | Rapporteur esthétique | G. Seguin | 24 |
| 1888 | Rapporteur esthétique de M. Charles Henry, notice sur ses applications à l'art industriel, à l'histoire de l'art, à l'interprétation de la méthode graphique, en général à l'étude et à la rectification esthétiques de toutes formes | G. Seguin | 31 |
| 1889 | Sur la dynamogénie et l'inhibition | Gauthier-Villars et fils | 4 |
| 1889 | Sur un cercle chromatique, un rapporteur et un triple décimètre esthétiques | Gauthier-Villars | — |
| 1889 | Éléments d'une théorie générale de la dynamogénie, autrement dit du contraste, du rythme et de la mesure | C. Verdin | 56 |
| 1890 | Application de nouveaux instruments de précision (cercle chromatique, rapporteur et triple décimètre esthétiques) à l'archéologie | Ernest Leroux | 31 |
| 1890 | Recherches expérimentales sur la sensibilité thermique | Gauthier-Villars | 3 |
| 1890 | Sur le principe et la graduation d'un thermomètre physiologique | — | — |
| 1890 | Sur une loi générale des réactions psycho-motrices... | Chaix | 37 |
| 1891 | Harmonies de formes et de couleurs | A. Hermann | 65 |
| 1891 | Influence de l'odeur sur les mouvements respiratoires et sur l'effort musculaire | — | — |
| 1891 | Notice sur les travaux scientifiques de M. Charles Henry | — | — |
| 1891 | Recherches expérimentales sur l'entraînement musculaire | — | — |
| 1892 | L'Olfactométrie et la physique des vapeurs | — | — |
| 1892 | Les odeurs | A. Hermann | 68 |
| 1892 | Préparation nouvelle et photométrie du sulfure de zinc phosphorescent | — | — |
| 1892 | Sur un nouveau photoptomètre permettant d'évaluer rapidement en fractions de bougie-mètre les éclairements les plus faibles | — | — |
| 1892 | Sur un photomètre-photoptomètre destiné à la mesure des faibles éclairements | — | — |
| 1892 | Sur une relation nouvelle entre les variations de l'intensité lumineuse et les numéros d'ordre de la sensation déterminée au moyen d'un lavis lumineux | — | — |
| 1892 | Une transformation de l'orchestre. Conférence faite au Théâtre d'application le 27 avril 1892 | — | — |
| 1893 | Sur le sulfure de zinc phosphorescent, considéré comme étalon photométrique | — | — |
| 1894 | Influence de la forme sur la sensibilité lumineuse et aberration de l'oeil | — | — |
| 1894 | Le Rôle du temps dans les phénomènes psychophysiologiques | — | — |
| 1894 | Le Temps de réaction à des impressions gustatives, mesuré par un compteur à secondes | — | — |
| 1894 | Oscillation diurne de la température animale | — | — |
| 1894 | Pupillométrie et photométrie | — | — |
| 1894 | Sur des lois nouvelles de la contraction pupillaire | — | — |
| 1894 | Sur les variations de grandeur apparente des lignes et des angles, dans la vision directe et dans la vision par des mouvements des yeux et de la tête | — | — |
| 1894 | Sur une méthode permettant de mesurer l'intensité de la vision mentale et l'aberration longitudinale de l'oeil | — | — |
| 1894 | Une nouvelle méthode de photométrie hétérochrome d'après M. Ogden N. Rood | — | — |
| 1894 | Une proposition paradoxale de la physiologie comparée des sports | — | — |
| 1895 | Abrégé de la théorie des fonctions elliptiques, à l'usage des candidats à la licence ès sciences mathématiques | Nony | 126 |
| 1895 | Démonstration, par un nouveau pupillomètre, de l'action directe de la lumière sur l'iris | — | — |
| 1895 | Influence du rythme des successions d'éclats sur la sensibilité lumineuse | — | — |
| 1895 | Quelques aperçus sur l'esthétique des formes | Nony | 61 |
| 1895 | Sur les variations de l'éclat apparent avec la distance et sur une loi de ces variations en fonction de l'intensité lumineuse | — | — |
| 1895 | Sur un dynamomètre de puissance spécialement applicable aux études physiologiques | — | — |
| 1896 | Applications à la tachymétrie et à l'ophtalmologie d'un mode de production, jusqu'ici inexpliqué, de la couleur | — | — |
| 1896 | Augmentation du rendement photographique des rayons Röntgen par le sulfure de zinc phosphorescent | — | — |
| 1896 | Energie musculaire et sensibilité. Méthode nouvelle de détermination des distances respectives de centres sensitifs aux centres moteurs | — | — |
| 1896 | Le Toton chromogène | — | — |
| 1896 | Lois d'établissement et de persistance de la sensation lumineuse ; déduites de recherches nouvelles sur les disques rotatifs | — | — |
| 1896 | Photométrie du sulfure de zinc phosphorescent excité par les rayons cathodiques dans l'ampoule de Crookes, par MM. Charles Henry et Gaston Seguy | — | 2 |
| 1896 | Sur la détermination, par une méthode photométrique nouvelle, des lois de la sensibilité lumineuse aux noirs et aux gris | — | — |
| 1896 | Sur la relation générale entre l'intensité de la sensation et la durée de l'excitation lumineuse | — | — |
| 1896 | Sur la relation générale qui relie à l'intensité lumineuse les degrés successifs de la sensation et sur les lois du contraste simultané des lumières et des teintes | — | — |
| 1896 | Sur le principe d'un accumulateur de lumière | — | — |
| 1896 | Sur les rayons Röntgen | — | — |
| 1896 | Sur les relations de la sensibilité thermique avec la température | — | — |
| 1896 | Sur un nouvel audiomètre et sur la relation générale entre l'intensité sonore et les degrés successifs de la sensation | — | — |
| 1896 | Sur une relation de l'énergie musculaire avec la sensibilité et sur les lois des variations de cette énergie en fonction du temps | — | — |
| 1896 | Utilité, en radiographie, d'écrans au sulfure de zinc phosphorescent ; émissions, par les vers luisants, de rayons traversant le papier aiguille | — | — |
| 1897 | Les rayons Röntgen | Société d'éditions scientifiques | 63 |
| 1897 | Sur un nouveau procédé d'électrisation | — | — |
| 1899 | Actino-photomètre fondé sur des relations entre l'éclat du sulfure de zinc phosphorescent et l'intensité ou la nature des sources excitatrices | — | — |
| 1899 | Développement des clichés photographiques à la lumière jaune de l'anactinochrine, par M. Charles Henry et Jules Courtier | — | — |
| 1899 | Les Petites misères du photographe. Les clichés rouges | — | — |
| 1899 | Les Propriétés électriques de la soie et de la laine, considérées comme un nouvel auto-régulateur de la constance de la température animale | — | — |
| 1903 | Sur l'équation générale des courbes de fatigue, par M. Charles Henry et Mlle J. Joteyko | — | — |
| 1903 | Sur le rendement des foyers lumineux et sur un dispositif très simple permettant d'augmenter le rendement lumineux des foyers à flamme et des lampes à pétrole en particulier | — | — |
| 1903 | Sur le travail statique du muscle | — | — |
| 1903 | Sur un criterium d'irréductibilité dans les ensembles statistiques | — | — |
| 1903 | Sur une loi de décroissance de l'effort à l'ergographe, par M. Charles Henry et Mlle J. Joteyko | — | — |
| 1903 | Sur une relation entre le travail et le travail dit "statique", énergétiquement équivalents à l'ergographe, par M. Ch. Henry et Mlle J. Joteyko | — | — |
| 1904 | Nouvelles recherches sur le "travail statique" du muscle | — | — |
| 1904 | Sur la croissance de l'homme et sur la croissance des êtres humains en général | — | — |
| 1904 | Sur la mesure et sur les lois des variations de l'énergie disponible à l'ergographe suivant la fréquence des contractions et le poids soulevé, par M. Charles Henry et Mlle J. Joteyko | — | — |
| 1904 | Sur les lois des travaux dits "statiques" du muscle | — | — |
| 1904 | Sur un dynamomètre totaliseur enregistreur... | — | — |
| 1904 | Sur une méthode de décomposition des ensembles statistiques complexes en ensembles irréductibles | — | — |
| 1905 | MM. Charles Henry et Louis Bastien... Recherches sur la croissance de l'homme et sur la croissance des êtres vivants en général | — | — |
| 1905 | Sur la mesure de l'énergie disponible par un dynamomètre totaliseur-enregistreur | — | — |
| 1906 | La Mesure des capacités intellectuelle et énergétique. Notes d'analyse statistique, par Charles Henry. Remarque additionnelle (sur l'interprétation sociologique de la distribution des salaires) par E. Waxweiler | — | — |
| 1906 | Projet d'un Bureau international d'enquête sur l'évolution de l'individu humain | impr. Ch. Colin | 4 |
| 1906 | Sur les lois de l'élasticité musculaire et leur application à l'énergétique | — | — |
| 1907 | A propos de colorants nouveaux. Considérations histologiques | — | — |
| 1907 | Interpolation des principales expériences de M. Chauveau sur l'énergétique musculaire | — | — |
| 1907 | Sur une méthode générale de production de colorations nouvelles | — | — |
| 1908 | A propos de colorants nouveaux, considérations histologiques, communication complémentaire | — | 16 |
| 1908 | A propos de colorants nouveaux. Considérations histologiques. Communication complémentaire par M. Charles Henry | — | — |
| 1908 | La loi des petits nombres | Laboratoire d'énergétique d'Ernest Solvay | 73 |
| 1908 | Psychophysique, énergétique et photométrie... | — | — |
| 1909 | Psycho-biologie et énergétique, essai sur un principe de méthodes intuitives de calcul | A. Hermann et fils | 217 |
| 1909 | Psycho-physique et énergétique | — | — |
| 1909 | Recherches nouvelles sur l'énergétique musculaire... | — | — |
| 1909 | Sur la fonction qui relie les masses atomiques aux accélérations de leurs constituants et sur la possibilité de calculer des masses atomiques nouvelles... | — | — |
| 1910 | L'Interpolation et l'énergétique psycho-biologique | — | — |
| 1910 | Mémoire et habitude | A. Hermann et fils | 116 |
| 1910 | Sensation et énergie | A. Hermann et fils | 296 |
| 1911 | Mémoire et habitude | [Institut général psychologique] | 117 |
| 1911 | Sensation et énergie | [Institut général psychologique] | 296 |
| 1912 | La Double surprise, comédie en 1 acte et en prose | Librairie de la plume | 32 |
| 1912 | Un drame au temps de Philippe II, drame en 8 tableaux | Librairie de la plume | 134 |
| 1918 | Rayonnement, gravitation, vie | [Institut général psychologique] | 76 |
| 1920 | Le Problème de la balnéothérapie | — | — |
| 1922 | La Lumière, la Couleur, la Forme | — | — |
| 1922 | Les Travaux français sur les problèmes de la théorie de la relativité | — | — |
| 1924 | Essai de généralisation de la théorie du rayonnement | — | — |
| 1927 | Progrès récents réalisés dans les fours verticaux par le correcteur système Candlot | — | — |
| 2010 | La vérité sur le marquis de Sade | la Bibliothèque | 90 |