| 1907 | Notes sur la flore du nord-ouest de Madagascar | Musée colonial | 50 |
| 1908 | Notes biologiques sur la végétation du nord-ouest de Madagascar. Les asclépiadées | Musée colonial | 109 |
| 1908 | Notes sur la flore du nord-ouest de Madagascar | Musée colonial | 45 |
| 1909 | Une asclépiadée sans feuille et une asclépiadée à tubercules du nord-ouest de Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 7 |
| 1910 | Henri Jumelle et H. Perrier de la Bathie. - Heckel (Edourad). Les plantes utiles de Madagascar | Adansonia, Coffea, etc). (Annales du Musée Coloniale de Marseilles, Dix-huitième année, 2e série | — |
| 1910 | Les Landolphia et les Mascarenhasia à caoutchouc du nord de l'Analalava | A. Challamel | 40 |
| 1910 | Termites champignonnistes et champignons des termitières à Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 36 |
| 1911 | Les Asclépiadées aphylles dans l'ouest de Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 16 |
| 1911 | Les Plantes à caoutchouc de l'ouest et du sud-ouest de Madagascar, par H. Jumelle et H. Perrier de La Bâthie | A. Challamel | 19 |
| 1911 | Les plantes à caoutchouc du nord de Madagascar | A. Challamel | 15 |
| 1912 | Contribution à l'étude des Crassulacées malgaches, par Raymond Hamet et Perrier de La Bâthie | Masson | — |
| 1912 | Histoire naturelle d'un lac de Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 8 |
| 1912 | Les Baobabs du sud-ouest de Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 12 |
| 1912 | Les Nervilia et les bulbophyllum du nord-ouest de Madagascar | A. Hermann et fils | — |
| 1912 | Quelques phanérogames parasites de Madagascar | Librairie générale de l'enseignement | 8 |
| 1913 | Les Medinilla de Madagascar, par H. Jumelle et H. Perrier de La Bâthie | Masson | — |
| 1913 | Osbeckiées malgaches | Musée colonial | 14 |
| 1913 | Palmiers de Madagascar, par Henri Jumelle et H. Perrier de La Bâthie | A. Challamel | 91 |
| 1913 | Plantes à caoutchouc de l'est de Madagascar, par H. Jumelle et H. Perrier de La Bâthie | A. Challamel | 32 |
| 1914 | Les baobabs de Madagascar | A. Challamel | 17 |
| 1914 | Nouvelle contribution à l'étude des Crassulacées malgaches | Musée colonial | 95 |
| 1915 | Nouvelles notes biologiques sur la flore malgache | A. Hermann et fils | — |
| 1916 | Troisième contribution à l'étude des Crassulacées malgaches | Musée colonial | 59 |
| 1921 | La Végétation Malgache | Challamel | 268 |
| 1921 | La végétation malgache | Musée colonial | 272 |
| 1926 | Le Tsaratanana, l'Ankaratra et l'Andringitra, 72 p., 1 carte h.t. au 1/80.000e. Mémoires de l'Académie malgache | Sans nom d'éditeur (s. n.) | — |
| 1926 | Les Lomatophyllum et les Aloe de Madagascar. (Mém. Soc. Linnienne de normandie, Caen, N.lle sér. Sect. botan. | Sans nom d'éditeur (s. n.) | 60 |
| 1927 | Le Tsaratanana, l'Ankaratra et l'Andringitra | impr. de G. Pitot | 71 |
| 1930 | Catalogue des plantes de Madagascar... "Orchidaceae", d'après R. Schlechter | impr. de G. Pitot | 60 |
| 1931 | Catalogue des plantes de Madagascar. Chlaenaceae [Chlaenacées] | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 11 |
| 1931 | Catalogue des plantes de Madagascar. Dioscoreaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 12 |
| 1931 | Catalogue des plantes de Madagascar. Scrofulariaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 14 |
| 1932 | Catalogue des plantes de Madagascar. Polygaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 11 |
| 1932 | Les Mélastomacées de Madagascar | impr. de H. Basuyau | 292 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar, publié par l'Académie malgache. Hydrocharitaceae, Burmaniaceae, Scitamineae, Musaceae, Iridaceae, Amaryllidaceae et Taccaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 19 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar. Balsaminaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 18 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar. Ericaceae et Vacciniaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 13 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar. Melastomaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 35 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar. Melastomaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 33 |
| 1934 | Catalogue des plantes de Madagascar. Podostemaceae et Hydrostachyaeceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 11 |
| 1935 | Catalogue des plantes de Madagascar. Xyridaceae, Pontederiaceae, Flagellariaceae, Juncaceae, Pandanaceae, Restionaceae, Typhaceae, Juncaginaceae, Araceae, Lemnaceae, Alismaceae, Triuridaceae, Najadaceae et Eriocaulaceae | Ed. géographiques, maritimes et coloniales | 23 |
| 1936 | Biogéographie des plantes de Madagascar | Société d'éditions géographiques maritimes et coloniales | 156 |
| 1936 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 40 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 147 |
| 1938 | Flore de Madagascar (Plantes vasculaires), publiée sous les auspices du Gouvernement général de Madagascar et sous la direction de H. Humbert,... 178e famille. Bignoniacées | Impr. officielle | 91 |
| 1938 | Flore de Madagascar(plantes vasculaires), publiée sous les auspices du Gouvernement général de Madagascar et sous la direction de H. Humbert,... 40e famille. Liliacées | Impr. officielle | 147 |
| 1939 | H. Perrier de La Bathie. Les Orchidées de la région malgache. (Variation, biologie et distribution) | — | — |
| 1940 | Révision des flacourtiacées de Madagascar et des Comores | [Muséum d'histoire naturelle] | 301 |
| 1941 | Flore de Madagascar Famille 49. - Tome II | Impr. officielle | 387 |
| 1941 | Orchidées | Impr. officielle | 387 |
| 1943 | Révision des Célastracées de Madagascar et des Comores | — | — |
| 1944 | H. Perrier de La Bathie. Révision des anacardiacées, burséracées et icacinacées de Madagascar et des Comores | — | — |
| 1945 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 143 | Muséum d'Histoire Naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1945 | Flore de Madagascar et des Comores... | Impr. officielle | 186 |
| 1945 | Flore de Madagascar et des Comores... 143e famille. Passifloracées | Impr. officielle | 50 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 150 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 106 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 118 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 8 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 24-Famille 27 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 33-Famille 35 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 38-Famille 39 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 45 |
| 1946 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 45-Famille 48 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phnérogamie | 70 |
| 1948 | H. Perrier de La Bathie. Revision de guttifères de Madagascar et des Comores | — | — |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 104-Famille 105 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 9 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 132-Famille 134 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 100 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 135-Famille 136 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 150 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 142 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 13 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 154-Famille 155 | Muséum d'Histoire Naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 41-Famille 43 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 44-Famille 44 bis | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 4 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 72-Famille 76 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 100 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores Fammille 123 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 123e famille. Rhamnacées | Firmin Didot | 51 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 132e famille. Dilléniacées. 133e famille. Ochnacées. 134e famille. Tchéacées | Firmin Didot | 16 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 135e famille. Hypéricacées. 136e famille. Guttifères | Firmin Didot | 96 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 142e famille. Turnéracées | Firmin Didot | 13 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 154e famille. Oenothéracées. 155e famille. Halorrhagacées | Firmin Didot | 13 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 41e famille. Amaryllidacées. 42e famille. Velloziacées. 43e famille. Taccacées | Firmin Didot | 5 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 44e famille. Dioscoréacées, par I. H. Burkill et H. Perrier de la Bâthie. Famille 44 bis. Trichopodacées | Firmin Didot | 4 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 72e famille. Basellacées. 73e famille. Caryophyllacées. 74e famille. Nymphéacées. 75e famille. Cératophyllacées. 76e famille. Renonculacées | Firmin Didot | 32 |
| 1950 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 79e famille. Myristicacées | Firmin Didot | 14 |
| 1951 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 153 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 326 |
| 1951 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 153e famille. Mélastomatacées | Firmin Didot | 327 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 101-Famille 103 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 100 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 112-Famille 113 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 40 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 119 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 45 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 165 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 137 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 166 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 89 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 55 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 76 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 79 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 13 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 88-Famille 89 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 60 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores(plantes vasculaires)... 88e famille. Podostémonacées. 89e famille. Hydrostachyacées | Firmin Didot | 32 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires, publiée sous les auspices du Gouvernement général de Madagascar... 101e famille | Firmin Didot | 12 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires, publiée sous les auspices du Gouvernement général de Madagascar... 165e famille. Ébénacées | Firmin Didot | 139 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 112e famille. Callitrichacées. 113e famille. Buxacées | Firmin Didot | 8 |
| 1952 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... 119e famille. Icacinacées | Firmin Didot | 46 |
| 1953 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 152 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 80 |
| 1953 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 161 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 148 |
| 1953 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires,... 152e famille. Myrtacées | Firmin Didot | 80 |
| 1953 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires,... 161e famille. Myrsinacées | Firmin Didot | 148 |
| 1954 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 136 bis-famille 139 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 100 |
| 1954 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 147-Famille 151 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 84 |
| 1954 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires, publiée sous les auspices du Gouvernement général de Madagascar... 147e famille. Lythracées. 148e famille. Sonneratiacées. 149e famille. Lécythidacées. Par H. Perrier de La Bâthie,... 150e famille. Rhizophoracées, par J. Arènes,... 151e famille. Combrétacées | Firmin Didot | 84 |
| 1954 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires... | Firmin Didot | 52 |
| 1955 | Flore de Madagascar et des Comores | Firmin Didot | 22 |
| 1955 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 108 bis-Famille 109 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 50 |
| 1955 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 129-Famille 130 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 21 |
| 1955 | Flore de Madagascar et des Comores Famille 181 | Muséum national d'histoire naturelle, Laboratoire de phanérogamie | 22 |
| 1955 | Flore de Madagascar et des Comores, plantes vasculaires, publiée... sous la direction de H. Humbert,... 181e famille. Lentibulariacées | Firmin Didot | 23 |